Chlamydia trachomatis và Neisseria Gonorrhoeae thường là nguyên nhân chính của bệnh viêm phổi. Dữ liệu cho thấy rằng PID thường là đa hình.[16] Isolated vi khuẩn kỵ khí và vi sinh vật tuỳ ý đã được lấy từ đường sinh dục trên. N. gonorrhoeae đã được phân lập từ ống dẫn trứng, các sinh vật gây bệnh và kỵ khí được phục hồi từ các mô nội mạc tử cung.[19]

Cấu trúc giải phẫu của các cơ quan nội tạng và các mô của đường sinh sản nữ cung cấp một con đường cho mầm bệnh đi từ âm đạo đến khoang chậu xuyên qua vùng kín. Sự xáo trộn của microbiota âm đạo xuất hiện tự nhiên liên quan đến viêm âm đạo do vi khuẩn làm tăng nguy cơ mắc bệnh viêm phổi.

N. lậu và C. trachomati s là những sinh vật phổ biến nhất. Ít phổ biến nhất là nhiễm trùng gây ra bởi anaerobes và các sinh vật khoa học. Anaerobes và vi khuẩn khoa học cũng được phân lập từ 50 phần trăm bệnh nhân mà Chlamydia và Neisseria đã được phục hồi; do đó, vi khuẩn kỵ khí và vi khuẩn gây bệnh đã có mặt ở đường sinh dục trên của gần hai phần ba số bệnh nhân mắc bệnh PID. Xét nghiệm PCR và huyết thanh học có liên quan đến sinh vật cực kỳ khó tính với viêm nội mạc tử cung, bệnh viêm phổi và yếu tố vô sinh. Các vi sinh vật liên quan đến PID được liệt kê dưới đây.

Hiếm khi các trường hợp mắc bệnh PID đã phát triển ở những người tuyên bố họ chưa bao giờ quan hệ tình dục.[20]